Project Experience

2015/03-2016/06  玉米着丝粒DNA甲基化分析(ChIP-Seq, BS-Seq, sRNA-Seq)               项目主持人

项目描述:本人主持的国家自然科学基金-青年项目,24万,2016-2018年。利用实验室前期发现的玉米新着丝粒材料,采用CenH3 ChIP-Seq获得着丝粒位置大小信息,进一步采用ChIP-BS-Seq富集着丝粒区DNA片段并进行甲基化分析,同时结合小RNA测序结果,分析功能着丝粒形成过程中小RNADNA甲基化在着丝粒区及核小体上的分布特征,提出小RNADNA甲基化参与功能着丝粒形成的模型。


2014/07-2016/06  植物多倍化机制(RNA-Seq, Histone modification ChIP-Seq)                主要完成

项目描述:以小麦为研究材料,分析异源多倍体二倍化的机制。对前期发现的天然和人工合成异源多倍体中rDNA差异失活的现象进行研究,开展转录组、小RNA5mC / H3K4me3 / H3K9me3 / H4K27me3 / H4K12ac ChIP-SeqBS-Seq的数据分析,发现潜在的表观遗传学调控机制,并采用VIGS技术对发现进行验证。


2011/09-2014/06   拟南芥和玉米小RNA簇的系统发现和功能研究                                            博士课题

项目描述:以拟南芥400多套公共数据为基础,全基因组系统鉴定小RNA簇,并对其进行分类、产生机制、胁迫响应相关功能进行研究。同时对玉米杂种优势相关小RNA研究,发现其在杂种优势形成中的潜在功能。发表英文综述1篇。


2008/09-2011/07   大豆miRNAs挖掘和潜在功能研究                                                                硕士课题

项目描述:设计基因组挖掘候选miRNAs的整套流程,同时结合启动子预测和功能分析,对miRNAs的表达样式和功能进行研究。

在该项目中,独立完成了编程和分析,并对分析结果进行分子生物学实验验证。本研究发表6篇研究论文,其中第一作者SCI论文三篇,并获黑龙江省第八届优秀硕士学位论文。



2016-Now

Metagenome  – Plant and microbiota interactions

2014-2016

DNA  methylation of maize centromere

Polyploidy  mechanism in plant

2011-2014

Systematic  analysis of functional SRCs in Arabidopsis.  Mainly the identification, biogenesis, tissue specificity and relation to stress  response analysis of SRCs

The  identification of heterosis related small RNA clusters (SRCs) in  maize

2009-2011

Analysis  of promoters and cis-acting  elements of miRNA genes in soybean

Genomic  identification novel miRNAs in soybean



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